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专业背景：计算机科学研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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PATH LD_LIBRARY_PATH LDFLAGS LD_RUN_PATH CFLAGS

2011-07-08 16:31:11| 分类： linux&shell | 标签： |举报 |字号大中小订阅

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http://blog.163.com/huangbao_007/blog/static/356365352008102301434362/

我安装的路径不是/usr，所以遇到了一些问题。下面就讲一下解决办法。
先来看几个相关的环境变量

PATH：大家应该都很熟悉。安装一个包后可能会在安装目录建立一个bin目录，里面都是些可执行程序，为了让系统能找到这些程序，就需要我们把该路径加入到PATH环境变量中。下面会讲到如何加入。

LDFLAGS：gcc等编译器会用到的一些优化参数，也可以在里面指定库文件的位置。用法：LDFLAGS=“-L/usr/lib -L/path/to/your/lib”。每安装一个包都几乎一定的会在安装目录里建立一个lib目录。如果你明明安装了某个包，而安装另一个包时，它愣是说找不到，那就把那个包的lib路径加入的LDFALGS中试一下吧。

LD_RUN_PATH
用来指定在编译时到哪些目录去寻找动态库，多个目录以冒号隔开

CFLAGS：和LDFLAGS类似，只不过要向里加如的是头文件（.h文件）的路径，如：CFLAGS=“-I/usr/include -I/path/to/your/include”。同样地，安装一个包时会在安装路径下建立一个include目录，当安装过程中出现问题时，试着把以前安装的包的include目录加入到该变量中来。

CPPFLAGS

CPPFLAGS 使安装程序在不同的目录下查找头文件

CFLAGS 与 CXXFLAGS
CFLAGS 表示用于 C 编译器的选项，CXXFLAGS 表示用于 C++ 编译器的选项,使安装程序在不同的目录下查找头文件

例如：

export HOME=/home/SCE/zhaolei

export PATH=$HOME/local/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/local/lib:$HOME/local/BerkeleyDB.4.5/lib:$LD_LIBRARY_PATH

export LIBRARY_PATH=$HOME/local/lib:$HOME/local/BerkeleyDB.4.5/lib:$LIBRARY_PATH
export LD_RUN_PATH=$LD_LIBRARY_PATH

export INCLUDE=$HOME/local/include:$INCLUDE

下面的变量一般不用设置：
export LDFLAGS="-L$HOME/local/lib -L$HOME/local/BerkeleyDB.4.5/lib"
export CPPFLAGS="-I$HOME/local/include -I$HOME/local/BerkeleyDB.4.5/include"
export CXXFLAGS=$CPPFLAGS
export CFLAGS=$CPPFLAGS

那如何在那些变量中加入这些路径呢？以PATH变量为例。
一种方法是：直接在命令行下：
$ PATH="$PATH:/path/to/your/bin:/another/path/to/bin"
$ export PATH
这种方法的好处是方便，立即生效，缺点是把当前会话或shell关了之后就失效了，下次还得运行一遍。

另一种方法是：把下面的两行内容加入到~/.bashrc文件中，如果想让其影响到整个系统而不仅仅是当前用户，就把下面的内容加入到/etc/bash.bashrc（记得有的系统是/etc/bashrc这个文件）

PATH="$PATH:/path/to/your/bin:/another/path/to/bin"
PATH and LDFLAGS and CFLAGS - Bob - 黄宝的博客

export PATH

然后，重新启动shell即可。

需要注意的是，PATH变量的分隔符是：号，其他的是空格，
所以LDFLAGS应该是这样：
LDFLAGS=“$LDFLAGS -L/path/to/lib -L/path/to/lib”
CFLAGS应该是这样：
CFLAGS=“$CFLAGS -I/path/to/iclude -I/path/to/include”

使用LD_LIBRARY_PATH

http://blog.csdn.net/dzassn/article/details/1770776
http://blog.csdn.net/lwhsyit/article/details/2830783

环境变量LD_LIBRARY_PATH用来指定查找共享库时除了默认路径之外的其他路径。(该路径在默认路径之前查找)
移植程序时的经常碰到需要使用一些特定的动态库，而这些编译好的动态库放在我们自己建立的目录里，这时我们可以设置LD_LIBRARY_PATH。
例：export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/work/lib/
这样就可以使用/work/lib/下的库文件了,运行程序后系统会自动到环境变量LD_LIBRARY_PATH指定的路径中查找其所需的库。

系统查找动态库的顺序
系统先找LD_LIBRARY_PATH下的库再找/lib and /usr/lib等路径下的库,还有/etc/ld.so.conf里指定的路径(如果ld.so.conf存在),man ldconfig for more information

使Linux启动之后就加载LD_LIBRARY_PATH的路径
/etc/rc.d/rc.local文件中加入export LD_LIBRARY_PATH="xxxxx" 即可

如果在链接时使用了"-R"和"-L"选项，则相关动态库的路径将保存在ELF文件中，于
是以后的运行中不再需要设置环境变量去定位动态库。比如，有一个
/usr/local/lib/libfoo.so，而你的bar程序需要这个libfoo.so，编译、链接时最好
这样：gcc -Wall -pipe -O3 -o bar -R/usr/local/lib -L/usr/local/lib bar.c -lfoo

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