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云之南

风声,雨声,读书声,声声入耳;家事,国事,天下事,事事关心

 
 
 

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关于我

专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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R-Advanced data handling Function  

2011-06-20 22:05:49|  分类: R&Bioconductor |  标签: |举报 |字号 订阅

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1. cut   convert a quantitative variable to a grouping factor
y <- stats::rnorm(100)
table(cut(y, breaks = pi/3*(-3:3)))
2.merge Merging data frames
authors <- data.frame(
surname = I(c("Tukey", "Venables", "Tierney", "Ripley", "McNeil")),
nationality = c("US", "Australia", "US", "UK", "Australia"),
deceased = c("yes", rep("no", 4)))
books <- data.frame(
name = I(c("Tukey", "Venables", "Tierney",
"Ripley", "Ripley", "McNeil", "R Core")),
title = c("Exploratory Data Analysis",
"Modern Applied Statistics ...",
"LISP-STAT",
"Spatial Statistics", "Stochastic Simulation",
"Interactive Data Analysis",
"An Introduction to R"),
other.author = c(NA, "Ripley", NA, NA, NA, NA,
"Venables & Smith"))

(m1 <- merge(authors, books, by.x = "surname", by.y = "name"))
(m2 <- merge(books, authors, by.x = "name", by.y = "surname"))
stopifnot(as.character(m1[,1]) == as.character(m2[,1]),
all.equal(m1[, -1], m2[, -1][ names(m1)[-1] ]),
dim(merge(m1, m2, by = integer(0))) == c(36, 10))

## "R core" is missing from authors and appears only here :
merge(authors, books, by.x = "surname", by.y = "name", all = TRUE)
3.split
ma <- cbind(x = 1:10, y = (-4:5)^2)
split(ma, col(ma))

split(1:10, 1:2)

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