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云之南

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专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

donor 与acceptor   

2010-03-22 16:51:11|  分类: 生物学 |  标签: |举报 |字号 订阅

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所谓的供体位点(donor)是基因内含子5'端GU的位置;受体位点(acceptor)是内含子3’端AG的位置,又称GU-AG法则,Chambon法测。对于mRNA或cDNA序列的分析是通过比对相关的基因组序列,来进行结构分析。例如,Spidey(是NCBI开发的工具软件),Sim4,BLAST等程序。NetGene2和Splice View可以提供编码区核苷酸序列剪切位点的直接预测。

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