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云之南

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专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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CpG岛  

2010-11-23 21:32:25|  分类: 生物学 |  标签: |举报 |字号 订阅

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中文名称:
CpG岛
英文名称:
CpG island
定义1:
基因组中长度为300~3000 bp的富含CpG二核苷酸的一些区域,主要存在于基因的5′区域。启动子区中CpG岛的未甲基化状态是基因转录所必需的,而CpG序列中的C的甲基化可导致基因转录被抑制。
定义2:
位于多种脊椎动物已知基因转录起始位点周围、由胞嘧啶(C)和鸟嘧啶(G)组成的串联重复序列
  CpG岛(CpG island):CpG双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一,而在基因组的某些区段,CpG保持或高于正常概率,这些区段被称作CpG岛,在哺乳动物基因组中的1~2kb的DNA片段,它富含非甲基化的CpG双倍体。CpG岛主要位于基因的启动子和第一外显子区域,约有60%以上基因的启动子含有CpG岛。GC含量大于50%,长度超过200bp
  CpG岛经常出现在真核生物的house-keeping基因的调控区,在其它地方出现时会由于CpG中的C易被甲基化而形成5'-甲基胞嘧啶,脱氨基后形成胸腺嘧啶,由于T本身就会存在于DNA中,因此不易被修复,所以被淘汰。故CpG在基因组中是以岛的形式分布的。
  CpG表示核苷酸对,其中G在DNA链中紧随C后。CpG对很少出现在人类基因中。然而,在许多基因的发起者(promotor)或“开始”区域周围,甲基化经常被抑制。这些区域包含浓度相对较高的CpG对,与染色体一起称作CpG岛,其长度通常在几百到几千核苷酸的长度内变化。
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