我们在linux常常用到一个程序需要加入参数,现在了解一下perl中的有关控制参数的函数.getopt.在linux有的参数有二种形式.一种是–help,另一种是-h.也就是-和–的分别.–表示完整参数.-表示简化参数. 在perl中也分这二种. Getopt::Std模块的功能:
初始化perl命令行中所接受的参数，简化了命令行参数的解析。 简化参数例子： #!/usr/bin/perl -w
use strict;
use Getopt::Std; use vars qw($opt_a $opt_b $opt_c);
getopts('a:b:c:'); #a: 这个冒号表示要有参数，不要冒号表示不要参数 print "\$opt_a =>; $opt_a\n" if $opt_a;
print "\$opt_b =>; $opt_b\n" if $opt_b;
print "\$opt_c =>; $opt_c\n" if $opt_c; 输出如下：
[root@mail test]# ./getopt.pl -a aa -b bb -c cc
$opt_a =>; aa
$opt_b =>; bb
$opt_c =>; cc 完整参数 #!/usr/bin/perl
use Getopt::Long;
Getopt::Long::GetOptions(
‘page=i’ => \$page,
‘onoff!’ => \$onoff,
‘help’ => \$wants_help,
‘name=s’ => \$name,
‘number:i’ => \$number);
if(defined($page)){
print "page flag set to $page ";
}
if(defined($onoff)){
print "onoff flag set to $onoff ";
}
if(defined($wants_help)){
print "help flag set to $wants_help ";
}
if(defined($name)){
print "name flag set to $name ";
}
if(defined($number)){
print "number flag set to $number ";
} ./getlong.pl -name AAA
name flag set to AAA 带值参数
※参数类型：整数, 浮点数, 字串 GetOptions( ‘tag=s’ => \$tag );
‘=’表示此参数一定要有参数值, 若改用’:'代替表示参数不一定要有参数值
’s’表示传递字串参数, 若为’i'表传递整数参数, 若为’f'表传递浮点数
example:
test.pl –tag=string
or
test.pl –tag string 参数别名
GetOptions (’length|height=f’ => \$length);
第一个名称为primary name, 其他的名称为alias(可有多个alias名称)
当使用hash参数时, 使用primary name作为key值 参数的简称及大小写
GetOptions (’length|height=f’ => \$length, "head" => \$head);
若没有特别设定, Getopt会忽略参数的大小写, 也就是 -l or -L 指的都
是同一个参数(–length) 对于不传递参数的选项，也就是一些开关类型，可以在第一部分后接“!”，这表示该选项不接收自变量，但 是可以 通过在前面加上no变成负的（例如，“more”选项的-nomore）。如果不是用“!”，而是“+”，这表示它会在每次出现的时候增加一个变量。如果 选项出现在命令行里，那么相关的变量被设置为1；如果负的选项出现了，那么相关的变量就被设置为0。
例子3：命令行参数，读取一个目录下面的所有文件名
#result $opt_i_muscle_nex.sh
#java CMDMuscle_clw_Format_nex /MK01_multi_dir_genus/*.clw MK01_multi_dir_genus/*.nex
#perl muscle_clw_nex_shell.pl -d path -p
#path MK01_multi_dir_genus #!/usr/bin/perl -w
use strict;
use Getopt::Std;
use vars qw($opt_d $opt_p);
getopts('d:p'); #$opt_i = "E:/MK01_multi_dir_genus"; my $outfile= "$opt_d"."_muscle_nex.sh";
my $filename=""; opendir (DIR,$opt_d) || die "Error in opening dir $opt_d\n";
while( ($filename= readdir(DIR))){
if($filename=~/[^\.]*\.clw/){
my $INfilename=$opt_d."/".$filename;
my $muscle_nex = "java CMDMuscle_clw_Format_nex $opt_d/$filename $opt_d/$filename.nex";
print("$filename\n");
open(makeFile," >>$outfile" )or die " Couldn't open $! ";
print makeFile "$muscle_nex\n";
}
}
closedir(DIR);
close makeFile;
print "complete"; 例子4：读取一个目录下面的所有文件 #!/usr/bin/perl
use warnings;
use strict; my %h="";
my $filename="";
my @arr="";
my $dirname="E:/Phyllostachys_edulis/PlnTF/"; opendir (DIR, $dirname)|| die "Error in opening dir $dirname\n"; while (($filename=readdir(DIR))){
next if $filename=~/^\./; open (FILE, "$dirname".$filename)|| die "can not open the file $filename\n";
while (<FILE>){
chomp;
@arr=split/\s+/, $_;
print "$filename\t$arr[0]\n"; }
} | 
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