云之南

风声，雨声，读书声，声声入耳；家事，国事，天下事，事事关心

日志

关于我

云之南

专业背景：计算机科学研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

文章分类

锌指结构

2010-01-09 11:26:34| 分类：遗传与基因组学 | 标签： |举报 |字号大中小订阅

下载LOFTER 我的照片书 |

锌指结构

锌指（zinc finger）：一种常出现在DNA结合蛋白中的一种结构基元。是由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn2+构成，形成的结构像手指状。

　　锌指结构指的是在很多蛋白中存在的一类具有指状结构的结构域，这些具有锌指结构的蛋白大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白。

　　锌指结构的共同特征是通过肽链中氨基酸残基的特征集团与Zn2+的结合来稳定一种很短的，可自我折叠成“手指”形状的的多肽空间构型。

　　锌指蛋白最初在非洲爪蟾的卵母细胞中发现，已知广泛分布在动物、植物和微生物中，人类基因组中可能有将近1％的序列编码的是含有锌指结构的蛋白质，目前人们已经清楚地知道锌指结构是识别特定碱基序列的一种普遍性的转录因子结构，但大多数含有锌指结构蛋白质的确切功能以及他们是否具有其他方面的功能尚不清楚。

20种氨基酸的疏水参数见下面：

Arg（R） -4.5

Lys（K） -3.9

Asn（N） -3.5

Asp（D） -3.5

Gln（Q） -3.5

Glu（E） -3.5

His（H） -3.2

Pro（P） -1.6

Tyr（Y） -1.3

Trp（W） -0.9

Ser（S） -0.8

Thr（T） -0.7

Gly（G） -0.4

Ala（A） 1.8

Met（M） 1.9

Cys（C） 2.5

Phe（F） 2.8

Leu（L） 3.8

Val（V） 4.2

Ile（I） 4.5

我要说的是疏水性与氨基酸的侧链有关，AA可分为脂肪族，芳香族，极性带电荷和极性不带电荷四种。前两种非极性，疏水性强；后两种极性还可能形成氢键，亲水；

评论这张

转发至微博

阅读(1203)| 评论(0)

历史上的今天

this.p={  m:2,
              b:2,
              loftPermalink:'',
              id:'fks_083069087086085075081086081095085094087074093087083071',
              blogTitle:'锌指结构',
              blogAbstract:'<div\><p style=\"TEXT-INDENT: 2em;\"   \>锌指结构</p\>  <p style=\"TEXT-INDENT: 2em;\"   \>　　 </p\>  <p style=\"TEXT-INDENT: 2em;\"   \><a rel=\"nofollow\" href=\"http://baike.baidu.com/image/b13fd4806b4149c49123d9a9\"   \><img title=\"锌指结构 - fhqdddddd - 流浪云南\"   alt=\"锌指结构 - fhqdddddd - 流浪云南\"   src=\"http://img.blog.163.com/photo/FpgO2eoeqUubArQ4RIynqQ==/300052325175146124.jpg\"   border=\"0\"   \></a\></p\>  <p style=\"TEXT-INDENT: 2em;\"   \>锌指（zinc finger）：一种常出现在DNA结合蛋白中的一种结构基元。是由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn2+构成，形成的结构像手指状。</p\>  <p style=\"TEXT-INDENT: 2em;\"   \>　　锌指结构指的是在很多蛋白中存在的一类具有指状结构的结构域，这些具有锌指结构的蛋白大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白。 </p\>  <p style=\"TEXT-INDENT: 2em;\"   \>　　锌指结构的共同特征是通过肽链中氨基酸残基的特征集团与Zn2+的结合来稳定一种很短的，可自我折叠成“手指”形状的的多肽空间构型。 </p\>  <p style=\"TEXT-INDENT: 2em;\"   \>　　锌指蛋白最初在非洲爪蟾的卵母细胞中发现，已知广泛分布在动物、植物和微生物中，人类基因</p\></div\>',
              blogTag:'',
              blogUrl:'blog/static/18699154201009112634669',
              isPublished:1,
              istop:false,
              type:0,
              modifyTime:1381825259899,
              publishTime:1263007594669,
              permalink:'blog/static/18699154201009112634669',
              commentCount:0,
              mainCommentCount:0,
              recommendCount:0,
              bsrk:-100,
              publisherId:0,
              recomBlogHome:false,
              currentRecomBlog:false,
              attachmentsFileIds:[],
              vote:{},
              groupInfo:{},
              friendstatus:'none',
              followstatus:'unFollow',
              pubSucc:'',
              visitorProvince:'',
              visitorCity:'',
              visitorNewUser:false,
              postAddInfo:{},
              mset:'000',
              mcon:'',
              srk:-100,
              remindgoodnightblog:false,
              isBlackVisitor:false,
              isShowYodaoAd:true,
              hostIntro:'专业背景：计算机科学                           \n\n研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发,\n生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统                                                                \n目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学',
              hmcon:'1',
              selfRecomBlogCount:'0',
              lofter_single:'<iframe width="140" height="560" style="overflow:hidden;" src="http://www.lofter.com/mailEntry.do?blogad=1&blog" frameBorder="0"></iframe>'
            }

{list a as x}
    {if !!x}
    <div class="iblock nbw-fce nbw-f40">
      <a class="fc03 noul" target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.visitorName}/">
      {if x.visitorName==visitor.userName}
      <img alt="${x.visitorNickname|escape}" onerror="this.src=location.f40" class="cwd bdwa bdc0" src="${fn1(x.visitorName)}&r=${visitor.imageUpdateTime}"/>
      {else}
      <img alt="${x.visitorNickname|escape}" onerror="this.src=location.f40" class="cwd bdwa bdc0" src="${fn1(x.visitorName)}"/>
      {/if}
      </a>
      <div class="cwd vname thide">
        {if x.moveFrom=='wap'}
          <a class="noul pnt" target="_blank" href="http://blog.163.com/services/wapblog.html?frompersonalbloghome"><span title="来自网易手机博客" class="iblock wapIcon"> </span></a>
        {elseif x.moveFrom=='iphone'}
          <a class="noul pnt" target="_blank"><span title="来自iPhone客户端" class="iblock iphoneIcon"> </span></a>
        {elseif x.moveFrom=='android'}
          <a class="noul pnt" target="_blank"><span title="来自Android客户端" class="iblock androidIcon"> </span></a>
        {elseif x.moveFrom=='mobile'}
          <a class="noul pnt" target="_blank" href="http://blog.163.com/services/emsblog.html?frompersonalbloghome"><span title="来自网易短信写博" class="iblock wapIcon"> </span></a>
        {/if}
        <a class="fc03 m2a"  target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.visitorName}/">
          ${fn(x.visitorNickname,8)|escape}
        </a>
      </div>
    </div>
    {/if}
    {/list}

<#--最新日志，群博日志--> <#--推荐日志-->

<p class="fc06">推荐过这篇日志的人：</p>
    <div>
      {list a as x}
      {if !!x}
      <div class="iblock nbw-fce nbw-f40">
        <a class="fc03 noul" target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.recommenderName}/">
        <img alt="${x.recommenderNickname|escape}" onerror="this.src=location.f40" class="cwd bdwa bdc0" src="${fn1(x.recommenderName)}"/>
        </a>
        <div class="cwd thide">
          <a class="fc03 m2a" target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.recommenderName}/">
            ${fn(x.recommenderNickname,6)|escape}
          </a>
        </div>
      </div>
      {/if}
      {/list}
    </div>
    {if !!b&&b.length>0}
    <p  class="fc06">他们还推荐了：</p>
    <ul>
    {list b as y}
      {if !!y}
        <li class="rrb"><span class="iblock">·</span><a class="fc03 m2a" target="_blank" href="http://blog.163.com/${y.recommendBlogPermalink}/?from=blog/static/18699154201009112634669">${y.recommendBlogTitle|escape}</a></li>
      {/if}
    {/list}
    </ul>
    {/if}

<#--引用记录--> <#--博主推荐--> <#--随机阅读--> <#--首页推荐--> <#--历史上的今天--> <#--被推荐日志--> <#--上一篇，下一篇--> <#-- 热度 -->

{list a as x}
    {if !!x}
    <div class="hotItem iblock nbw-fce nbw-f40">
      <a class="fc03 noul" target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.publisherUsername}/">
      {if x.publisherUsername==visitor.userName}
      <img alt="${x.publisherNickname|escape}" onerror="this.src=location.f40" class="cwd bdwa bdc0" src="${fn1(x.publisherUsername)}&r=${visitor.imageUpdateTime}"/>
      {else}
      <img alt="${x.publisherNickname|escape}" onerror="this.src=location.f40" class="cwd bdwa bdc0" src="${fn1(x.publisherUsername)}"/>
      {/if}
      </a>
      <div class="cwd vname thide">
        <a class="fc03 m2a"  target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.publisherUsername}/">
          ${fn(x.publisherNickname,8)|escape}
        </a>
      </div>
      <a class="f-myLikeIcons hottype {if x.type==1} js-liketype{elseif x.type==2} js-reblogtype{elseif x.type==3} js-sharetype{else}{/if}" target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.publisherUsername}/"> </a>
    </div>
    {/if}
    {/list}

<#-- 网易新闻广告 --> <#--右边模块结构--> <#--评论模块结构--> <#--引用模块结构--> <#--博主发起的投票-->

页脚

我的照片书 - 手机博客 - 下载LOFTER APP - 订阅此博客

云之南

导航

日志

锌指结构

历史上的今天

最近读者

热度

评论

页脚