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4_关于R的一些基本知识

2009-12-04 11:10:14| 分类： R&Bioconductor | 标签： |举报 |字号大中小订阅

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4_关于R的一些基本知识

Author: F.Xu

20 Apr

首先看一下这一次要讲的内容。

什么是对象（Object）

如何改变工作目录

关于扩展包（库函数）

R的数据类型

环境设置函数options()

接下来，我们一个一个的简单介绍。

1，什么是对象（Object）

在用R进行数据分析和计算的时候，将会用到很多变量、函数、数组等等。而对象则是对所有这些变量、函数、数组等的总称。
比如说，下面这个式子：
x <- 2

在用R进行数据分析和计算的时候，将会用到很多变量、函数、数组等等。而对象则是对所有这些变量、函数、数组等的总称。比如说，下面这个式子：x <- 2通常我们会说，x是一个变量，我们通过赋值运算把它的值设为2。但是在R里，不论我们是给一个变量赋值也好，还是对一个数组进行初始化也好，我们统统把它称为[对象]。

下面的对象是R的预设对象。我们在命名自己的对象时，是不能与下面这些对象重名的。

break
else
for
function
if
TRUE
in
next
repeat
return
while
FALSE

另外：
使用objects()函数，还可以查看目前存在的对象名。
使用rm()函数，可以消除自己所定义过的对象。（例如： rm(killme) ）
使用rm(list=ls(all=TRUE))命令，可以消除自己所定义过的所有的对象。
命名对象时，要注意大小写。（例如：x和X是两个不同的对象）

2、如何改变工作目录

你可以用getwd()命令来查看当前目录，也可以用类似setwd(”c:/usr”)的命令来更改当前的目录。

你还可以用dir()命令来查看当前目录里的文件。（好像回到了dos时代…呵呵）

3、关于扩展包（库函数）

R有很好的扩展性能，默认下R自带了以下的扩展包。

base：R的基本扩展包
boot：R的启动函数库
class：Classification的函数库
cluster：进行聚类分析计算的函数库
foreign：读取其它的统计软件（如：SAS…）等生成的文件的函数库
grid：grid图像函数库
KernSmooth：进行核函数密度估计运算的函数库
lattice：lattice图像函数库
MASS：在『Modern Applied Statistics with S』中出现的数据与函数库
methods：定义了在R中用于对象的各种方法、类、程序以及工具。
mgcv：GCV和一般加法模型GAM（generalized additive model）的函数库
nlme：线性混合效果模型和非线性混合效果模型的函数库
nnet：
rpart：使用了再归算法的分类和回归树的函数库
spatial：
splines：splines回归的函数库
stats：R的统计函数库
stats4：S4类的统计函数库
survival：
tcltk：Tcl/Tk的接口函数库
tools：用于扩展包开发和管理的函数库
utils：

另外：
使用library(help=”扩展包名”)命令可以查看该扩展包的详细信息
使用library(扩展包名)命令可以使用该扩展包
使用search()命令可以查看现在已经读取的扩展包
使用detach(”package:扩展包名”)命令可以卸载某个扩展包
使用data()命令可以查看当前可使用的数据对象
使用data(package = “扩展包名”)命令可以查看在该扩展包中的数据对象

扩展包的安装：
使用下面的命令，可以联网安装扩展包。
options(CRAN=”http://cran.r-project.org”)
install.packages(”扩展包名”)

如果你已经下载了扩展包的ZIP压缩文件，你可以用下面的命令指定路径安装扩展包。
install.packages(”路径名/文件名.zip”, contriburl = NULL)
例如：install.packages(”c:/adapt_1.0-4.zip”, contriburl = NULL)

当然，你也可以通过菜单操作下载和安装扩展包，请自己研究。

3、R的数据类型

R中包含以下的基本数据类型。

空值（NULL）
意义：该对象里什么都没有（甚至连0也没有）

欠损值、不定值（NA），非数（NaN），无限大（Inf）
意义：NA:表示数据缺损；NaN:表示用数字无法表示；Inf:无限大

复数（complex）
意义：复数

字符串（character）
意义：不是单一的字符，而是用双/单引号括起来的字符

逻辑值（logical）
意义：T表示真，F表示假

4，环境设置函数options()

用options()命令可以设置一些环境变量。

比如说：

options(digits=10)
这个命令，可以把R的整数表示能力设为10位。

options(warn=-1)
这个命令，可以忽视任何警告。（warn=1时，为不放过任何警告）
……

使用help(options)可以查看详细的参数信息。

呵呵，今天就先到这里~~

2006/6/19更新：添加扩展包的说明

RWEKA:

WEKA是一个JAVA写的数据挖掘的工具，RWEKA则是在R中调用WEKA的一个界面。

扩展包说明&下载地址(英文)：http://cran.r-project.org/src/contrib/Descriptions/RWeka.html

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