注册 登录  
 加关注
   显示下一条  |  关闭
温馨提示!由于新浪微博认证机制调整,您的新浪微博帐号绑定已过期,请重新绑定!立即重新绑定新浪微博》  |  关闭

云之南

风声,雨声,读书声,声声入耳;家事,国事,天下事,事事关心

 
 
 

日志

 
 
关于我

专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

网易考拉推荐

4_关于R的一些基本知识  

2009-12-04 11:10:14|  分类: R&Bioconductor |  标签: |举报 |字号 订阅

  下载LOFTER 我的照片书  |

4_关于R的一些基本知识

Author: F.Xu

20 Apr

首先看一下这一次要讲的内容。

  1. 什么是对象(Object)
  2. 如何改变工作目录
  3. 关于扩展包(库函数)
  4. R的数据类型
  5. 环境设置函数options()

接下来,我们一个一个的简单介绍。

1,什么是对象(Object)

在用R进行数据分析和计算的时候,将会用到很多变量、函数、数组等等。而对象则是对所有这些变量、函数、数组等的总称。
比如说,下面这个式子:
x <- 2

在 用R进行数据分析和计算的时候,将会用到很多变量、函数、数组等等。而对象则是对所有这些变量、函数、数组等的总称。比如说,下面这个式子:x <- 2通常我们会说,x是一个变量,我们通过赋值运算把它的值设为2。但是在R里,不论我们是给一个变量赋值也好,还是对一个数组进行初始化也好,我们统统把 它称为[对象]。

下面的对象是R的预设对象。我们在命名自己的对象时,是不能与下面这些对象重名的。

break
else
for
function
if
TRUE
in
next
repeat
return
while
FALSE

另外
使用objects()函数,还可以查看目前存在的对象名。
使用rm()函数,可以消除自己所定义过的对象。( 例如: rm(killme) )
使用rm(list=ls(all=TRUE))命令,可以消除自己所定义过的所有的对象。
命名对象时,要注意大小写。(例如:x和X是两个不同的对象)

2、如何改变工作目录

你可以用getwd()命令来查看当前目录,也可以用类似setwd(”c:/usr”)的命令来更改当前的目录。

你还可以用dir()命令来查看当前目录里的文件。(好像回到了dos时代…呵呵)

3、关于扩展包(库函数)

R有很好的扩展性能,默认下R自带了以下的扩展包。

base:R的基本扩展包
boot:R的启动函数库
class:Classification的函数库
cluster:进行聚类分析计算的函数库
foreign:读取其它的统计软件(如:SAS…)等生成的文件的函数库
grid:grid图像函数库
KernSmooth:进行核函数密度估计运算的函数库
lattice:lattice图像函数库
MASS:在『Modern Applied Statistics with S』中出现的数据与函数库
methods:定义了在R中用于对象的各种方法、类、程序以及工具。
mgcv:GCV和一般加法模型GAM(generalized additive model)的函数库
nlme:线性混合效果模型和非线性混合效果模型的函数库
nnet:
rpart:使用了再归算法的分类和回归树的函数库
spatial:
splines:splines回归的函数库
stats:R的统计函数库
stats4:S4类的统计函数库
survival:
tcltk:Tcl/Tk的接口函数库
tools:用于扩展包开发和管理的函数库
utils:

另外
使用library(help=”扩展包名”)命令可以查看该扩展包的详细信息
使用library(扩展包名)命令可以使用该扩展包
使用search()命令可以查看现在已经读取的扩展包
使用detach(”package:扩展包名”)命令可以卸载某个扩展包
使用data()命令可以查看当前可使用的数据对象
使用data(package = “扩展包名”)命令可以查看在该扩展包中的数据对象

扩展包的安装
使用下面的命令,可以联网安装扩展包。
options(CRAN=”http://cran.r-project.org”)
install.packages(”扩展包名”)

如果你已经下载了扩展包的ZIP压缩文件,你可以用下面的命令指定路径安装扩展包。
install.packages(”路径名/文件名.zip”, contriburl = NULL)
例如:install.packages(”c:/adapt_1.0-4.zip”, contriburl = NULL)

当然,你也可以通过菜单操作下载和安装扩展包,请自己研究。

3、R的数据类型

R中包含以下的基本数据类型。

空值(NULL)
意义  :该对象里什么都没有(甚至连0也没有)

欠损值、不定值(NA),非数(NaN),无限大(Inf)
意义  :NA:表示数据缺损;NaN:表示用数字无法表示;Inf:无限大

复数(complex)
意义  :复数

字符串(character)
意义  :不是单一的字符,而是用双/单引号括起来的字符

逻辑值(logical)
意义  :T表示真,F表示假

4,环境设置函数options()

用options()命令可以设置一些环境变量。

比如说:

options(digits=10)
这个命令,可以把R的整数表示能力设为10位。

options(warn=-1)
这个命令,可以忽视任何警告。(warn=1时,为不放过任何警告)
……

使用help(options)可以查看详细的参数信息。

呵呵,今天就先到这里~~

 

2006/6/19更新: 添加扩展包的说明

RWEKA:

WEKA是一个JAVA写的数据挖掘的工具,RWEKA则是在R中调用WEKA的一个界面。

扩展包说明&下载地址(英文):http://cran.r-project.org/src/contrib/Descriptions/RWeka.html


  评论这张
 
阅读(876)| 评论(0)
推荐 转载

历史上的今天

在LOFTER的更多文章

评论

<#--最新日志,群博日志--> <#--推荐日志--> <#--引用记录--> <#--博主推荐--> <#--随机阅读--> <#--首页推荐--> <#--历史上的今天--> <#--被推荐日志--> <#--上一篇,下一篇--> <#-- 热度 --> <#-- 网易新闻广告 --> <#--右边模块结构--> <#--评论模块结构--> <#--引用模块结构--> <#--博主发起的投票-->
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

页脚

网易公司版权所有 ©1997-2016