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云之南

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我国量子生物学最早10年(e书下载)  

2009-12-19 22:41:56|  分类: 生物信息学 |  标签: |举报 |字号 订阅

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我国量子生物学最早10年 ( e书下载))
[ 2008-12-21 18:05:00 | By: seabbi ]
  http://www.bbioo.com/blog/bio/seabbi/
  http://biohjanime.blog.sohu.com/
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我国量子生物学最早10年(80年代)
我国量子生物学开始于70年代末,在80年代量子生物学是一门热冂的学科,有许多人研究.
依据刘次全主编:量子生物学及其应用
它反映了当时国内外量子生物学研究工作,更是反映了国内主要量子生物研究成果,有些研究是处于当时国际水平.


(1)江寿平研究组 中科院上海生物化学研究所
吴伟雄 宣建成 乐树云 刘志平  (全是硕士)
81年编写了国内首个量子化学从头计算程序,它的计算速度超过当时国际上通用的从头计算程序. 为了解决在分子轨道计算中自洽迭代中发散这一重大难题, 该组提出了二个新的分子轨道计算公式(DSF和CDSF), 介决了上述难题. 应用这新公式编写了新的CNDO和从头计算程序.利用这新的CNDO程序计算了环化鸟苷酸双聚体和铁卟啉双聚体,提出了它们双聚体构象的模型,这是文献上报道用此法得到的最大的分子. 同时并对量子生物学著作中提出的当时无法用CNDO 法计算的ATP分子,应用这个新公式,不仅用CNDO,而且用更精确和更困难的从头计算法成功地进行了计算,也是用此法得到的最大的分子, 这是用国外从头计算程序不能得到的. 提出了新的计算公式和发展了新的计算方法,介决了当时国际上的上述难题,从电子水平阐明了腺苷酸和酶的相互作用机制, 揭示了分子的作用机理, 构象, 水合作用,  用从头计算法首次得到了一些分子的电子结构精确数据和其它一些用实验未能得到信息,使有的研究是处于当时国际领先水平,开拓了我国量子生物学领域.
1.cGMP 从头计算法研究 生物化学与生物物理学报 1990
2 COMPLEX DIAGONAL SHIFT FORMULA (CDSF) IN SCF ITERATIVE PROCESS  Science in China,Ser.B   1989
3.自洽场迭代中的复对角位移法 中国科学B辑 1989
4. Ab initio STUDIES ON ADENOSINE TRIPHOSPHATE  Chinese Science Bulletin 1988
5. A MOLECULAR ORBITAL STUDY ON ADENOSINE PHOSPHATES  Science in China,Ser.B 1987
6.腺苷三磷酸的从头计算法研究 科学通报 1987
7.腺嘌呤核苷磷酸的分子轨道研究 中国科学B辑 1987
8.Electronic Structure of Adenosine Phosphate  Satellite Symposium on MoMolecular Electronics and Biocomputers 1987
9.环化腺苷酸和蛋白激酶的结合部位——从头计算法的研究 温元凯 生物物理学报 1987
10 STUDIES ON THE PROBLEM OF CONVERGENCE IN SCF ITERATIVE PROCESS OF QUANTUM CHEMISTRY  Science in China,Ser.B 1987
11.关于量子化学自洽场迭代中收敛问题的探讨 中国科学B辑 1986
12 ELECTRONIC STRUCTURE OF ATP 江寿平 Chinese Science Bulletin 1986
13.腺苷三磷酸分子的电子结构 科学通报 1985
14. SCF MO简化公式及其应用 南京大学学报(化学版) 1985
15.CNDO calculation of ATP  The China-Japan Bitateral Symposium on Biophysics 1985
16.环化鸟苷酸双聚体堆积构象的研究 结构化学 1983
17.H2O-H2S 超系统研究 分子科学学报 1983
18.环状核苷酸的构象和电子结构 分子科学学报 1982
19.SIBM:从头计算程序 生物化学与生物物理 1982
20.转动群在自洽场分子轨道理论中的一点应用 自然杂志 1981
21.环化鸟苷酸构象的计算 科学通报 1981
22.量子生物学-1 生物科学动态 1979
23.量子生物学-2 生物科学动态 1979
24.量子生物学入门(原为日文) 1979
国内唯一一本量子生物学中文书,是量子生物学研究工作者必读之书,它为发展我国量子生物学起了一定的作用.


(2)嵇汝运 研究组 中科院上海药物研究所
陈凯先 吴吉安(量子药理学方面)
编写了微型计算机的量子化学程序集,最早应用分子轨道理论在药物研究上,开拓了我国量子药理学领域.这里仅列出量子药理学方面论文(1979-1890): "量子生物学及其应用"有一章是吴吉安写的
1 A STUDY ON CONFIGURATION-ACTIVITY RELATIONSHIP OF DIAMMINEDICHLOROPLATINUM (Ⅱ) BY THE PSEUDOPOTENTIAL VALENCE ELECTRON-ONLY ab initio CALCULATION METHOD  Science in China,Ser.B 1987
2 用CNDO/2法计算分子静电势程序设计 吴吉安 华西药学杂志 1986
3 用量子化学赝势价电子从头计算法研究二氯二氨合铂的构型-活性关系 陈凯先 中国科学B辑 1986
4 量子化学非经验计算方法及其在药物和生物学研究中的应用  中国医药工业杂志 1985
5 用于微型计算机的量子化学程序集  化学通报 1984
6 量子化学——药物研究的有力工具  化学通报 1984
7 大分子的量子化学从头计算技术及其程序化  分子科学学报 1982
8 量子化学赝势法半从头计算程序MQMMP的设计  分子科学学报 1981
9 分子轨道法在药理研究中的一些应用 黄锦凡 医学分子生物学杂志 1981/04 南京师范学院
10 抗疟新药青蒿素及其衍生物的分子轨道研究  分子科学学报 1981
11 若干α、β-不饱和环酮及内酯类化合物的平喘活性与分子轨道指数间的关系  药学学报 1981
12 二苯硫醚类药物Hückel分子轨道计算  药学学报 1981
13 分子轨道理论与药物研究Ⅱ.分子轨道理论在药物研究上的应用  国外医学.药学分册 1979
14 分子轨道理论与药物研究 Ⅰ.分子轨道理论简介  国外医学.药学分册 1979

(3)温元凯研究组 中国科学技术大学
他在量子生物学方面应用分子静电势对胰岛素,木瓜蛋白酶和核酸等做了研究.书中有一章对这些作做了描述,但没引用参考文献,而引用了一大堆国外文献.下列参考文献是新加的.温元凯也是我国量子生物学先锋之一,他现是经济学家.
1.木瓜蛋白酶的量子化学研究1 分子科学学报 1982
2.木瓜蛋白酶的量子化学研究2 分子科学学报 1983
3. THE CALCULATION OF THE MOLECULAR ELECTROSTATIC POTENTIAL FORTHE INSULIN MOLECULE  Chinese Science Bulletin 1984
4.胰岛素的分子静电势计算 科学通报 1984 
5.核酸的分子静电势[Ⅰ] 大自然探索 1983
6.核酸的分子静电势[Ⅱ] 大自然探索 1984
7.核酸的分子静电势[Ⅲ] 大自然探索 1985
7.胰岛素二聚体相互作用能的计算 高等学校化学学报 1986
9.胰岛素分子主链构象的CNDO/2计算和比较 邵俊 温元凯 高等学校化学学报 1989
 
(4)肖奕(华中工学院) 陈润生(中科院生物物理研究所)
书中详细描述了运用晶体轨道法研究Na+对Poly(Gly)和基酸残基侧链对蛋白质能带结构的影响,肖奕是国内最早应用晶体轨道法研究生物分子.下列参考文献(4-5外)是新加的.
1.水对多聚α-门冬酰胺能带结构的影响  生物物理学报 1989
2.比较互洽场水模型与部分真实水模型对蛋白质能带结构的影响  生物物理学报 1988
3.半经验CNDO/2晶体轨道法的程序设计及算例 生物化学与生物物理进展 1986
4.蛋白质能带结构的晶体轨道法研究 Ⅲ金属离子和水对蛋白质能带结构的影响  生物物理学报 1986
5.EFFECT OF THE SIDE CHAINS OF AMINO ACID RESIDUES ON THE ENERGY BAND STRUCTURES OF PROTEINS——INVESTIGATION BY CRYSTAL ORBITAL METHOD  Chinese Science Bulletin 1986
6.氨基酸残基侧链对蛋白质能带结构的影响——晶体轨道法研究  科学通报 1985
7.蛋白质能带结构的晶体轨道法研究——Ⅱ蛋白质构象的变化对其能带结构的影响  生物物理学报 1985
8.鸟苷的电子结构及其在碱基旋转过程中的变化  分子科学学报 陈润生 1982
9.量子生物学简介 刘若庄  分子科学学报  1982
10.基于从头算的缬氨酸两性离子和水分子的相互作用势 凌伦奖 生物物理学报 1990


(5)刘次全
他对发展国内量子生物学有贡献
1.刘次全主编:"量子生物学及其应用" 1990
这是一本内容手富,广泛,反映了当时理论生物学,特别是量子生物学,量子药理学主要成果和新的发展趋势,国外也很少见.
2.刘次全  量子生物学引论 1989
3.THE FORTRAN PROGRAM OF HMO METHOD 刘次全 Chinese Science Bulletin 1983
4.一种HMO法FORTRAN程序 科学通报 1982
5.超离域度与多环芳烃的致癌作用 分子科学学报 1981
6.化学致癌作用的量子生物学研究浅介 刘次全 自然杂志 1980 
(6)王志中,张学忠, 程玉华 吉林大学
1.cAMP和cGMP与蛋白激酶相互作用的量子生物学研究(Ⅰ)——cAMP及cGMP分子中糖—磷酸环部分的电荷分布 分子科学学报 1982
2.A QUANTUM BIOCHEMICAL APPROACH TO THE INTERACTIONS OF CYCLIC AMP AND GMP WITH PROTEIN KINASE (Ⅱ) ——THE  
ELECTRONIC STRUCTURES OF 5 -CH2-cAMP AND cGM 高等学校化学学报 1984
3.量子生物学讲义


(7)姚新民 量子生物学概论 1990
(8)刘若庄 量子生物学简介   分子科学学报  1982
(9)林克椿 量子生物学 生理科学进展 1978
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下载从网上收集的e书
1 量子化学从头计算法(上、中、下册)
http://home.imhb.cn/indexCF/home/MyDocumentDown.aspx?MSAutoID=162135
2 分子动力学讲义
http://home.imhb.cn/indexCF/home/MyDocumentDown.aspx?MSAutoID=167344
3 图解量子化学
http://home.imhb.cn/indexCF/home/MyDocumentDown.aspx?MSAutoID=128059
4 量子化学讲义
http://home.imhb.cn/indexCF/home/MyDocumentDown.aspx?MSAutoID=169905
5 清华大学计算量子化学讲义
http://filedown.imhb.cn/myspace/download.aspx?mediaid=169903&sid=81b1c480a2a9ff9f60e3ba3371703b54
6-8 唐敖庆量子化学 徐光宪量子化学基本原理 江元生分子模拟讲义
http://home.imhb.cn/indexCF/home/MyDocumentDown.aspx?MSAutoID=166469
9-34 Reviews in Computational Chemistry, Volume 01-25
http://home.imhb.cn/indexCF/home/MyDocument.aspx?pageno=1&huid=506826&catalog=0&catalogname=所有文件
35 Molecular Modelling Principles And Applications 2Ed
http://download.csdn.net/source/666427
36 Computational Chemistry
http://home.imhb.cn/indexCF/home/MyDocumentDown.aspx?MSAutoID=147242
37.Computational Medicinal Chemistry for Drug Discovery
http://download.csdn.net/source/666443
 

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