云之南

风声，雨声，读书声，声声入耳；家事，国事，天下事，事事关心

日志

关于我

云之南

专业背景：计算机科学研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

文章分类

我国计算生物学最早20年 ( e书下载)

2009-12-19 22:41:03| 分类：生物信息学 | 标签： |举报 |字号大中小订阅

下载LOFTER 我的照片书 |

我国计算生物学最早20年
[ 2009-1-5 11:41:00 | By: seabbi ]
http://www.bbioo.com/blog/bio/seabbi/
http://biohjanime.blog.sohu.com/
0
推荐我国计算分子生物学最早的20年(70-89)
应用数理及计算机科学研究生物学问题,特别是通过用计算机进行计算研究.这里主要是在分子水平.

江寿平研究组中科院上海生物化学研究所
周国城乐树云吴伟雄阮康成郭志鲲
我国计算生物学研究开始于70年代初江寿平研究组.当时酶动力学面临着一个尖锐的问
题,即酶反应速率实验所得的与按传统理论所算出的不一致.这被认为是酶动力学中一个
“危机”.为了介决酶学中这个问题,提出了一个新的酶反应速率公式和理论，应用计算
机进行计算,从而解决了上述“危机",成为七十年代重大科学技术成果. 这是国内第一次
应用计算机到生物学理论研究中,也是酶反应动力学领域首次应用计算机.此后应用改进
的分子相互作用势能法和蒙特卡罗模拟研究生物分子相互作用和核酸碱基分子的水合作
用.开拓了我国计算生物学这一领域.这些研究结果,由刘次全等人编入"量子生物学及其应
用"一书一些章节中.
1.STUDIES ON THE RATE OF DIFFUSIONCONTROLLED REACTIONS OF
ENZYMES SPATIAL FACTOR AND FORCE FIELD FACTOR    Science in China,Ser.A 1974
2.酶的扩散控制反应速率的研究——方向因素与力场因素中国科学A辑 1975
3.THE QUANTITATIVE RELATIONS BETWEEN DIFFUSION-CONTROLLED
REACTION RATE AND CHARACTERISTIC PARAMETERS IN ENZYME-SUBSTRATE
REACTION SYSTEMS Ⅱ.CHARGED SUBSTRATES Science in China,Ser.A 1975
4.酶-底物反应体系的特征参量与扩散控制反应速率间定量关系的研究——带电底物中国科学A辑 1975
5.酶-底物分子之间相互作用力对反应速率的影响生物化学与生物物理学报 1976
6.THE QUANTITATIVE RELATIONS BETWEEN DIFFUSION-CONTROLLED
REACTION RATE AND CHARACTERISTIC PARAMETERS IN ENZYME-SUBSTRATE
REACTION SYSTEMS Ⅰ. NEUTRAL SUBSTRATES Science in China,Ser.A 1976
7.INFLUENCE OF ENZYME-SUBSTRATE INTERACTION FORCES ON REACTION
RATES Science in China,Ser.A 1977
8.STUDIES ON THE COMBINATION RATES OF LIQUID PHASE FAST REACTION
SYSTEMS Science in China,Ser.A 1977
9.酶和底物分子之间相互作用力对扩散控制反应速率的影响中国科学A辑 1977
10.关于液相快速反应体系中结合反应速率的研究——瞬间相过程与定态过程中国科学A辑 1977
11.酶动力学的图形理论——定态反应体系中国科学A辑 1978
12.酶-底物反应体系中底物分子的浓度图科学通报 1978
13.A concerntration map of enzyme-substrate reaction, Science Bulletin 1978
14.GRAPH THEORY OF ENZYME KINETICS STEADY-STATE REACTION SYSTEMS
Science in China,Ser.A    1979
15.稀溶液正则系综的计算机模拟—腺嘌呤溶液的热力学量的蒙特卡罗计算分子科学学报 1981
16.改进的分子相互作用势能法生物化学与生物物理学报 1981
17.碱金属离子与 DNA 中碱基,配对碱基,双联体的相互作用生物化学与生物物理进展 1981
18.核酸碱基分子的水合作用研究生物化学与生物物理进展 1981
19.计算机在分子生物学中的应用自然杂志 1982
20.密码子与反密码子的识别和相互作用分子科学学报 1982
21.核酸碱基(胞嘧啶)水合作用的蒙特卡罗模拟科学通报 1982
22.MONTE-CARLO SIMULATION OF THE NUCLEIC ACID BASE (CYTOSINE) HYDRATION Science Bulletin    1982
23.B—DNA分子中互补碱基对G—C、A—T水合作用的研究结构化学 1983
24.cGMP双聚体堆积构象的研究结构化学 1983
25.cAMP的相互作用和动力学 International Conferenceon NMR in Biological System 1986
26.RNA分子的折叠及其动态过程生物物理学报 1987

陈润生研究组中科院生物物理研究所
倪向善石秀凡岳琳王化军张学军凌伦奖
研究蛋白质合成过程的动力学和生物分子(胰岛素和氨基酸)水合的蒙特卡罗模拟.
陈润生也是我国计算生物学开拓者之一.
刘次全编的"量子生物学及其应用"一书中仅引用了文献6.
1.翻译水平的动力学模型大连铁道学院学报   1980年
2.分子构型对蛋白质合成过程动力学结构的影响分子科学学报 1982
3.分子构型和蛋白质的宏观动力学结构科学通报 1982
4.蛋白质合成中动力学结构形成过程的研究科学通报 1982
5.蛋白质合成(翻译)过程的动力学模型中国科学B辑 1982
6.DYNAMIC MODEL OF TRANSLATION PHASE Science in China,Ser.B 1982
7.MOLECULAR CONFIGURATION AND MACROSCOPIC DYNAMIC STRUCTURE OF PROTEIN Chinese   Science Bulletin 1983
8.STUDIES ON EVOLUTION OF DYNAMIC STRUCTURE OF PROTEIN SYNTHESIS Chinese Science Bulletin 1983
9.生物分子水溶液的Monte Carlo模拟——丙氨酸溶液中国科学B辑 1985
10.MONTE CARLO SIMULATION ON AQUEOUS SOLUTION OF BIOLOGICAL MOLECULES——ALANINE SOLUTION   Science in China,Ser.B 1985
11.生物分子水溶液的蒙特卡罗模拟——Ⅱ.缬氨酸溶液生物物理学报 1985
12.细胞色素C中肽段相对运动的动力学分析生物物理学报 1985
13.胰岛素分子的水合等能图科学通报 1986
14.胰岛素B4(Gln)两种可能构象的计算判别科学通报 1986
15.对环二肽cyclo—(L—His—L—Thr)与水亲合特性的Monte Carlo模拟生物物理学报 1986
16.去七肽胰岛素的分子动力学研究   生物物理学报 1986
17.细菌视紫红质的构象模拟和视黄醛的顺反异构模型生物物理学报 1989

郝鸣鸿杨频山西大学分子科学研究所
1.生物大分子的构型能量分析郝鸣鸿化学通报 1984
2.生物高分子规则螺旋结构构型能量的计算大自然探索 1986

评论这张

转发至微博

阅读(790)| 评论(0)

历史上的今天

this.p={  m:2,
              b:2,
              loftPermalink:'',
              id:'fks_083071081086086074085086095095085094087074093087083071',
              blogTitle:'我国计算生物学最早20年 ( e书下载)',
              blogAbstract:'  <P\>我国计算生物学最早20年 <BR\>[ 2009-1-5 11:41:00 | By: seabbi ] <BR\><A rel=\"nofollow\" href=\"http://www.bbioo.com/blog/bio/seabbi/\" \>http://www.bbioo.com/blog/bio/seabbi/</A\><BR\><A rel=\"nofollow\" href=\"http://biohjanime.blog.sohu.com/\" \>http://biohjanime.blog.sohu.com/</A\><BR\>0<BR\>推荐我国计算分子生物学最早的20年(70-89)<BR\>应用数理及计算机科学研究生物学问题,特别是通过用计算机进行计算研究.这里主要是在分子水平.</P\>  <P\><BR\>江寿平研究组 中科院上海生物化学研究所<BR\>周国城 乐树云 吴伟雄 阮康成 郭志鲲</P\>',
              blogTag:'',
              blogUrl:'blog/static/186991542009111910413925',
              isPublished:1,
              istop:false,
              type:0,
              modifyTime:1337834691628,
              publishTime:1261233663925,
              permalink:'blog/static/186991542009111910413925',
              commentCount:0,
              mainCommentCount:0,
              recommendCount:0,
              bsrk:-100,
              publisherId:0,
              recomBlogHome:false,
              currentRecomBlog:false,
              attachmentsFileIds:[],
              vote:{},
              groupInfo:{},
              friendstatus:'none',
              followstatus:'unFollow',
              pubSucc:'',
              visitorProvince:'',
              visitorCity:'',
              visitorNewUser:false,
              postAddInfo:{},
              mset:'000',
              mcon:'',
              srk:-100,
              remindgoodnightblog:false,
              isBlackVisitor:false,
              isShowYodaoAd:true,
              hostIntro:'专业背景：计算机科学                           \n\n研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发,\n生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统                                                                \n目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学',
              hmcon:'1',
              selfRecomBlogCount:'0',
              lofter_single:'<iframe width="140" height="560" style="overflow:hidden;" src="http://www.lofter.com/mailEntry.do?blogad=1&blog" frameBorder="0"></iframe>'
            }

{list a as x}
    {if !!x}
    <div class="iblock nbw-fce nbw-f40">
      <a class="fc03 noul" target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.visitorName}/">
      {if x.visitorName==visitor.userName}
      <img alt="${x.visitorNickname|escape}" onerror="this.src=location.f40" class="cwd bdwa bdc0" src="${fn1(x.visitorName)}&r=${visitor.imageUpdateTime}"/>
      {else}
      <img alt="${x.visitorNickname|escape}" onerror="this.src=location.f40" class="cwd bdwa bdc0" src="${fn1(x.visitorName)}"/>
      {/if}
      </a>
      <div class="cwd vname thide">
        {if x.moveFrom=='wap'}
          <a class="noul pnt" target="_blank" href="http://blog.163.com/services/wapblog.html?frompersonalbloghome"><span title="来自网易手机博客" class="iblock wapIcon"> </span></a>
        {elseif x.moveFrom=='iphone'}
          <a class="noul pnt" target="_blank"><span title="来自iPhone客户端" class="iblock iphoneIcon"> </span></a>
        {elseif x.moveFrom=='android'}
          <a class="noul pnt" target="_blank"><span title="来自Android客户端" class="iblock androidIcon"> </span></a>
        {elseif x.moveFrom=='mobile'}
          <a class="noul pnt" target="_blank" href="http://blog.163.com/services/emsblog.html?frompersonalbloghome"><span title="来自网易短信写博" class="iblock wapIcon"> </span></a>
        {/if}
        <a class="fc03 m2a"  target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.visitorName}/">
          ${fn(x.visitorNickname,8)|escape}
        </a>
      </div>
    </div>
    {/if}
    {/list}

<#--最新日志，群博日志--> <#--推荐日志-->

<p class="fc06">推荐过这篇日志的人：</p>
    <div>
      {list a as x}
      {if !!x}
      <div class="iblock nbw-fce nbw-f40">
        <a class="fc03 noul" target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.recommenderName}/">
        <img alt="${x.recommenderNickname|escape}" onerror="this.src=location.f40" class="cwd bdwa bdc0" src="${fn1(x.recommenderName)}"/>
        </a>
        <div class="cwd thide">
          <a class="fc03 m2a" target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.recommenderName}/">
            ${fn(x.recommenderNickname,6)|escape}
          </a>
        </div>
      </div>
      {/if}
      {/list}
    </div>
    {if !!b&&b.length>0}
    <p  class="fc06">他们还推荐了：</p>
    <ul>
    {list b as y}
      {if !!y}
        <li class="rrb"><span class="iblock">·</span><a class="fc03 m2a" target="_blank" href="http://blog.163.com/${y.recommendBlogPermalink}/?from=blog/static/186991542009111910413925">${y.recommendBlogTitle|escape}</a></li>
      {/if}
    {/list}
    </ul>
    {/if}

<#--引用记录--> <#--博主推荐--> <#--随机阅读--> <#--首页推荐--> <#--历史上的今天--> <#--被推荐日志--> <#--上一篇，下一篇--> <#-- 热度 -->

{list a as x}
    {if !!x}
    <div class="hotItem iblock nbw-fce nbw-f40">
      <a class="fc03 noul" target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.publisherUsername}/">
      {if x.publisherUsername==visitor.userName}
      <img alt="${x.publisherNickname|escape}" onerror="this.src=location.f40" class="cwd bdwa bdc0" src="${fn1(x.publisherUsername)}&r=${visitor.imageUpdateTime}"/>
      {else}
      <img alt="${x.publisherNickname|escape}" onerror="this.src=location.f40" class="cwd bdwa bdc0" src="${fn1(x.publisherUsername)}"/>
      {/if}
      </a>
      <div class="cwd vname thide">
        <a class="fc03 m2a"  target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.publisherUsername}/">
          ${fn(x.publisherNickname,8)|escape}
        </a>
      </div>
      <a class="f-myLikeIcons hottype {if x.type==1} js-liketype{elseif x.type==2} js-reblogtype{elseif x.type==3} js-sharetype{else}{/if}" target="_blank" hidefocus="true" href="http://blog.163.com/${x.publisherUsername}/"> </a>
    </div>
    {/if}
    {/list}

<#-- 网易新闻广告 --> <#--右边模块结构--> <#--评论模块结构--> <#--引用模块结构--> <#--博主发起的投票-->

页脚

我的照片书 - 手机博客 - 下载LOFTER APP - 订阅此博客

云之南

导航

日志

我国计算生物学最早20年 ( e书下载)

历史上的今天

最近读者

热度

评论

页脚