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云之南

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专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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植物生态式物种形成研究获得进展  

2015-11-25 21:32:30|  分类: 遗传与基因组学 |  标签: |举报 |字号 订阅

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植物生态式物种形成研究获得进展

http://paper.sciencenet.cn/htmlpaper/2015111810204277037736.shtm

生态式物种形成是新物种产生的重要方式。尽管已有大量研究探索其遗传机理,但对表达调控在生态式物种形成中的作用仍知之甚少。近日,中科院植物所葛颂研究组以野生稻为材料,在全基因组水平上探讨了表达调控进化在物种形成和适应性进化中的作用,相关成果发布于《分子生物学与进化》

栽培稻近缘野生种Oryza rufipogon 和O. nivara 是近期分化的姊妹种,在形态、生境和生殖等方面存在显著差异,因此是研究物种形成的理想体系。研究人员通过对2个野生种3个生殖相关组织的转录组进行测 序,发现约8%的基因在种间发生了显著的表达分化,并随机分布在基因组上。其中,约62%差异表达基因的表达模式受方向性选择的影响;相对于编码区,差异 表达基因上游区域比非差异表达基因进化速度更快,说明基因调控在物种分化中起到了关键作用。进一步功能注释分析发现,差异表达基因显著集中在与生殖和逆境 响应相关的基因上,这与2个野生种在表型和生态上的分化相一致。

该研究首次在全基因组水平上探讨了基因调控在植物物种形成中的作用,说明生态式物种形成伴随着广泛且具有适应性的表达分化,为进一步理解植物物种形成提供了重要证据。

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