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云之南

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专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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达马拉鼹鼠基因组  

2014-10-07 17:03:35|  分类: 遗传与基因组学 |  标签: |举报 |字号 订阅

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http://paper.sciencenet.cn/htmlpaper/20149112513376534393.shtm

 

8月29日,深圳华大基因研究院、哈佛医学院等单位联合完成达马拉鼹鼠基因组图谱的绘制工作,并揭示了与地下鼠低氧、抗压、长寿等特性相关的遗传学机制。相关成果发表于《细胞报告》杂志。

研究表明,达马拉鼹鼠有212个基因家族发生了扩张,59个基因家族发生了收缩;而裸鼹鼠有378个基因家族发生了扩张,29个基因家族发生了收缩。扩张 的基因家族中有较多为嗅觉感受器基因家族,这揭示了两者在黑暗环境下嗅觉功能进化的分子机制;收缩和丢失的基因家族中有很多视觉相关的基因,同时在两者基 因组中检测到10多个视觉相关的假基因,这些基因的功能丧失揭示了地下鼠视觉退化的分子机制。

研究还发现,地下鼠的肝脏具有不同的基因表达模式。6个过氧化物氧化还原酶中的PRDX2和PRDX5均具有较低的表达水平,同时GPx1的活性降低。这 意味着这两种地下鼠的活性氧(ROS)水平会增强,也说明了这两种地下鼠能在较高的氧化应激下保持长寿。此外,两种鼹鼠的胰岛素水平均较低,而较低的代谢 速率也可能是地下鼠长寿的原因之一
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