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云之南

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专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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Grep学习笔记  

2013-03-24 21:14:41|  分类: linux&shell |  标签: |举报 |字号 订阅

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http://www.linuxso.com/command/grep.html

1. grep简介
2. grep正则表达式元字符集(基本集)
3. 用于egrep和 grep -E的元字符扩展集
4. POSIX字符类
5. Grep命令选项
6. 实例

1. grep简介

grep (global search regular expression(RE) and print out the line,全面搜索正则表达式并把行打印出来)是一种强大的文本搜索工具,它能使用正则表达式搜索文本,并把匹配的行打印出来。Unix的grep家族包 括grep、egrep和fgrep。egrep和fgrep的命令只跟grep有很小不同。egrep是grep的扩展,支持更多的re元字符, fgrep就是fixed grep或fast grep,它们把所有的字母都看作单词,也就是说,正则表达式中的元字符表示回其自身的字面意义,不再特殊。linux使用GNU版本的grep。它功能 更强,可以通过-G、-E、-F命令行选项来使用egrep和fgrep的功能。

grep的工作方式是这样的,它在一个或多个文件中搜索字符串模板。如果模板包括空格,则必须被引用,模板后的所有字符串被看作文件名。搜索的结果被送到屏幕,不影响原文件内容。

grep可用于shell脚本,因为grep通过返回一个状态值来说明搜索的状态,如果模板搜索成功,则返回0,如果搜索不成功,则返回1,如果搜索的文件不存在,则返回2。我们利用这些返回值就可进行一些自动化的文本处理工作。

2. grep正则表达式元字符集(基本集)

^

锚定行的开始 如:'^grep'匹配所有以grep开头的行。

$

锚定行的结束 如:'grep$'匹配所有以grep结尾的行。

.

匹配一个非换行符的字符 如:'gr.p'匹配gr后接一个任意字符,然后是p。

*

匹配零个或多个先前字符 如:'*grep'匹配所有一个或多个空格后紧跟grep的行。 .*一起用代表任意字符。

[]

匹配一个指定范围内的字符,如'[Gg]rep'匹配Grep和grep。

[^]

匹配一个不在指定范围内的字符,如:'[^A-FH-Z]rep'匹配不包含A-R和T-Z的一个字母开头,紧跟rep的行。

\(..\)

标记匹配字符,如'\(love\)',love被标记为1。

\<

锚定单词的开始,如:'\<grep'匹配包含以grep开头的单词的行。

\>

锚定单词的结束,如'grep\>'匹配包含以grep结尾的单词的行。

x\{m\}

重复字符x,m次,如:'0\{5\}'匹配包含5个o的行。

x\{m,\}

重复字符x,至少m次,如:'o\{5,\}'匹配至少有5个o的行。

x\{m,n\}

重复字符x,至少m次,不多于n次,如:'o\{5,10\}'匹配5--10个o的行。

\w

匹配文字和数字字符,也就是[A-Za-z0-9],如:'G\w*p'匹配以G后跟零个或多个文字或数字字符,然后是p。

\W

\w的反置形式,匹配一个或多个非单词字符,如点号句号等。

\b

单词锁定符,如: '\bgrep\b'只匹配grep。

3. 用于egrep和 grep -E的元字符扩展集

+

匹配一个或多个先前的字符。如:'[a-z]+able',匹配一个或多个小写字母后跟able的串,如loveable,enable,disable等。

?

匹配零个或多个先前的字符。如:'gr?p'匹配gr后跟一个或没有字符,然后是p的行。

a|b|c

匹配a或b或c。如:grep|sed匹配grep或sed

()

分组符号,如:love(able|rs)ov+匹配loveable或lovers,匹配一个或多个ov。

x{m},x{m,},x{m,n}

作用同x\{m\},x\{m,\},x\{m,n\}

4. POSIX字符类

为 了在不同国家的字符编码中保持一至,POSIX(The Portable Operating System Interface)增加了特殊的字符类,如[:alnum:]是A-Za-z0-9的另一个写法。要把它们放到[]号内才能成为正则表达式,如[A- Za-z0-9]或[[:alnum:]]。在linux下的grep除fgrep外,都支持POSIX的字符类。

[:alnum:]

文字数字字符

[:alpha:]

文字字符

[:digit:]

数字字符

[:graph:]

非空字符(非空格、控制字符)

[:lower:]

小写字符

[:cntrl:]

控制字符

[:print:]

非空字符(包括空格)

[:punct:]

标点符号

[:space:]

所有空白字符(新行,空格,制表符)

[:upper:]

大写字符

[:xdigit:]

十六进制数字(0-9,a-f,A-F)

5. Grep命令选项

-?

同时显示匹配行上下的?行,如:grep -2 pattern filename同时显示匹配行的上下2行。

-b,--byte-offset

打印匹配行前面打印该行所在的块号码。

-c,--count

只打印匹配的行数,不显示匹配的内容。

-f File,--file=File

从文件中提取模板。空文件中包含0个模板,所以什么都不匹配。

-h,--no-filename

当搜索多个文件时,不显示匹配文件名前缀。

-i,--ignore-case

忽略大小写差别。

-q,--quiet

取消显示,只返回退出状态。0则表示找到了匹配的行。

-l,--files-with-matches

打印匹配模板的文件清单。

-L,--files-without-match

打印不匹配模板的文件清单。

-n,--line-number

在匹配的行前面打印行号。

-s,--silent

不显示关于不存在或者无法读取文件的错误信息。

-v,--revert-match

反检索,只显示不匹配的行。

-w,--word-regexp

如果被\<和\>引用,就把表达式做为一个单词搜索。

-V,--version

显示软件版本信息。

6. 实例

要用好grep这个工具,其实就是要写好正则表达式,所以这里不对grep的所有功能进行实例讲解,只列几个例子,讲解一个正则表达式的写法。

$ ls -l | grep '^a'

通过管道过滤ls -l输出的内容,只显示以a开头的行。

$ grep 'test' d*

显示所有以d开头的文件中包含test的行。

$ grep 'test' aa bb cc

显示在aa,bb,cc文件中匹配test的行。

$ grep '[a-z]\{5\}' aa

显示所有包含每个字符串至少有5个连续小写字符的字符串的行。

$ grep 'w\(es\)t.*\1' aa

如果west被匹配,则es就被存储到内存中,并标记为1,然后搜索任意个字符(.*),这些字符后面紧跟着另外一个es(\1),找到就显示该行。如果用egrep或grep -E,就不用"\"号进行转义,直接写成'w(es)t.*\1'就可以了。

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