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云之南

风声,雨声,读书声,声声入耳;家事,国事,天下事,事事关心

 
 
 

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关于我

专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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基于第二代高通量测序数据分析在线教程  

2013-03-24 18:34:44|  分类: 生物信息学 |  标签: |举报 |字号 订阅

  下载LOFTER 我的照片书  |

http://www.personal.psu.edu/iua1/pages/fall-2012-bmmb-597D.html
这个教程的主要内容包括:

1、了解生物信息各种常见数据文件格式和标准

2、熟悉目前常用的二代测序仪(Illumina HiSeq、ABI SOLID以及Roche 454)的短reads的分析

3、短序列、长序列的比对

4、Chip-Seq分析以及peak calling

5、SNP分析以及基因组变异分析

6、基因组拼接组装

8、宏基因组(metagenomics)数据分析

9、利用R以及其他软件包对分析的数据进行可视化与画图

。。。。。

教程名称:Fall 2012 - Analyzing High Throughput Sequencing Data

教程的网址:http://www.personal.psu.edu/iua1/pages/fall-2012-bmmb-597D.html
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