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云之南

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关于我

专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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已发表动物基因组(慢慢更新)  

2013-11-01 11:38:36|  分类: 遗传与基因组学 |  标签: |举报 |字号 订阅

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已发表动物基因组信息收录(119)

中文名 拉丁名 发表时间  刊物 科、属 基因组大小
秀丽隐杆线虫 Caenorhabditis elegans 1998.12 Science 小杆总科、Caenorhabditis亚属 97M
黑腹果蝇 Drosophila melanogaster 2000.03 Science 果蝇科、果蝇属 180M
冈比亚按蚊 Anopheles gambiae 2002.10 Science  蚊科、按蚊属 280M
小家鼠 Mus musculus 2002.12 Nature  鼠科 2.5 G
红鳍东方豚 Fugu rubripes 2002.12 Science  鲀科、东方鲀属 380M
玻璃海鞘 Ciona intestinalis 2002.12 Science  海鞘纲 150M
线虫 Caenorhabditis briggsae 2003.11 PLoS Biology Caenorhabditis亚属 104M
大鼠 Rattus norvegicus 2004.04 Nature  啮齿目、鼠科 2.75 G
黑斑鲀 Tetraodon nigroviridis 2004.10 Nature  鲀科 340M
家蚕 Bombyx mori 2004.12 Science 鳞翅目、蚕蛾科 428.7 M
Gallus sonneratii 2004.12 Nature 雉科、原鸡属 1.06G
拟暗果蝇 Drosophila pseudoobscura 2005.01 Genome research 果蝇科、果蝇属 139M
克氏锥虫 Trypanosoma cruzi 2005.07 Science 锥虫属 67M
黑猩猩 Pan troglodytes 2005.09 Nature  猩猩科、黑猩猩属 2.7G
Canis familiaris 2005.12 Nature  犬科、犬属 2.5 G
意蜂 Apis mellifera 2006.10 Nature 昆虫纲 236M
海胆 Strongylocentrotus purpuratus 2006.11 Science 海胆纲 1G
姥鲨 Callorhinchus milii 2007.04 Plos Biology 软骨鱼纲、银鲛目 0.91G
猕猴 Macaca mulatta 2007.04 Science  猴科、猕猴属 2.87G
短尾负鼠 Monodelphis domestica 2007.05 Nature  负鼠科、短尾负鼠属 3.4G
青鳉鱼 Oryzias latipes 2007.06 Nature 青鳉属 700M
伊蚊 Aedes aegypti 2007.06 Science  蚊科、伊蚊属 1376M
马来线虫 Brugia malayi 2007.07 Science  线虫纲 90M
海葵 Nematostella vectensis 2007.07 Science  海葵目 357M
12种果蝇基因组进化分析(10种新) D.sechellia,D.simulans 2007.11 Nature 果蝇科、果蝇属  
Felis catus 2007.11 Genome Research  猫科、猫属 2.7G
赤拟谷盗 Tribolium castaneum 2008.04 Nature  鞘翅目、拟步行虫科、拟谷盗属 204M
鸭嘴兽 Ornithorhynchus anatinus 2008.05 Nature  鸭嘴兽科、鸭嘴兽属 1.84G
文昌鱼 Branchiostoma floridae 2008.06 Nature  文昌鱼科、文昌鱼属 520M
丝盘虫 Trichoplax adhaerens 2008.08 Nature  丝盘虫科、丝盘虫属 104M
根结线虫 Meloidogyne incognita 2008.08 Nature Biotechnology 线虫属 86M
古猛犸象 Mammuthus primigenius 2008.11 Nature  象科、猛犸象属 4.7G
Bos taurus 2009.04 Science  牛科、牛属 2.87 G
裂吸虫 Schistosoma mansoni 2009.07 Nature  血吸虫属 360M
血吸虫 Schistosoma japonicum 2009.07 Nature  血吸虫属 397M
Equus caballus 2009.11 Science  马科、马属 2.7G
熊猫 Ailuropoda melanoleura 2010.01 Nature  熊科、大熊猫属 2.25G
金小蜂 Nasonia vitripennis, N. giraulti, N. longicornis 2010.01 Science  膜翅目、金小蜂科 295M
豌豆蚜虫 Acyrthosiphon pisum. 2010.02 PLoS Biology   517M
水螅 Hydra 2010.03 Nature  水螅科、水螅属 1.05G
非洲爪蟾 Xenopus tropicalis 2010.04 Science 负子蟾科、非洲爪蟾属 1.7 G
珍珠鸟 Taeniopygia guttata 2010.04 Nature  文鸟科、梅花雀属 1.2G
人类体虱 Pediculus humanus humanus 2010.07 PNAS 人虱属 110M
海绵 Amphimedon queenslandica 2010.08 Nature 多空动物门 190M
蚂蚁 Camponotus floridanus ,Harpegnathos saltator 2010.08 Science 蚁科 C. floridanus240 Mb; H. saltator330 Mb
火鸡 Meleagris gallopavo 2010.09 PLoS Biology 吐绶鸡科、吐绶鸡属 1.1 Gb
库蚊 Culex quinquefasciatus 2010.10 Nature 蚊科、库蚊属 540M
异体住囊虫 Oikopleura 2010.11 Science 脊索动物门、被囊动物亚门 148M
红毛猩猩 Pongo abelii Pongo pygmaeus 2011.01 Nature 猩猩科 3.09G
阿根廷蚁 Linepithema humile 2011.01 PNAS 蚁科 250.8M
红色收割蚁 Pogonomyrmex barbatus 2011.01 PNAS 蚁科 250–284 M
火蚁 Solenopsis invicta 2011.01 PNAS 蚁科 484.2M
水蚤 Daphnia pulex 2011.02 Science 甲壳纲,鳃足亚纲,水蚤科 200M
大头切叶蚁 Atta cephalotes 2011.02 PLoS Genetics 蚁科 300M
旋毛虫 Trichinella spiralis 2011.02 Nature Genetics  毛形科、毛形属 64M
袋獾 Sarcophilus harrisii 2011.06 PNAS 袋獾属 3.3G
顶切叶蚁 Acromyrmex echinatior 2011.06 Genome Research  顶切叶蚁属 313M
鹿角珊瑚 Acropora digitifera 2011.07 Nature 珊瑚虫纲 420M
巨蟒 Python molurus bivittatus 2011.07 Genome Biology  爬行纲 1.4G
大西洋鳕鱼 Gadus morhua 2011.08 Nature 鳕形目、鳕属 830M
澳大利亚袋鼠 Macropus eugenii 2011.08 Genome Biology 有袋目、袋鼠科 2.9G
绿蜥蜴 Anolis carolinensis 2011.09 Nature 爬行纲、有鳞目 1.78G
裸鼹鼠 Heterocephalus glaber 2011.10 Nature 啮齿目\裸鼹鼠属 2.6G
食蟹猴和中国恒河猴 Macaca fascicularis,Macaca mulatta lasiota 2011.10 Nature Biotechnology 猴科、猕猴属 2.85G
猪蛔虫 Ascaris suum 2011.10 Nature 蛔虫属 272M
二斑叶螨(棉红蜘蛛) Tetranychus urticae 2011.11 Nature 叶螨科、叶螨属 90M
帝王蝶 Danaus plexippus 2011.11 Cell 斑蝶属 273M
指猴(夜狐猴) Daubentonia madagascariensis 2011.12 Genome Biology and Evolution 指猴属 3G
鲶鱼 Ictalurus punctatus 2011.12 BMC Genomics 鲶科、鲶属 1G
埃及血吸虫 Schistosoma haematobium 2012.01 Nature Genetics  血吸虫属 385M
中华肝吸虫 Clonorchis sinensis 2011.10 Genome Biology  线虫纲 516M
鳄鱼 Crocodylus siamensis 2012.01 Genome Biology 爬行纲、鳄目 2.5G
马氏珠母贝 Pinctada fucata 2012.02 DNA Research 珍珠贝科、珠母贝属
1150M
大猩猩 Gorilla gorilla gorilla 2012.03 Nature  猩猩科 3.04G
三刺鱼 Gasterosteus aculeatus 2012.04 Nature  刺鱼目、刺鱼科、刺鱼属 463M
诗神袖蝶 Heliconius melpomene 2012.05 Nature  蛱蝶科、 釉蛱蝶属 269M
倭黑猩猩 Pan paniscus 2012.06 Nature  猩猩科、黑猩猩属 2.7G
虎皮鹦鹉 Melopsittacus undulatus 2012.07 Nature Biotechnology 鹦鹉科、虎皮鹦鹉属 1.2G
牦牛 Bos grunniens 2012.07 Nature Genetics  牛科、牛属 2.66G
北极熊 Ursus maritimus 2012.07 PNAS 熊科、棕熊属 2.53G
间日疟原虫 Plasmodium vivax 2012.08 Nature Genetics  疟原虫科、疟原虫属 Brazil I 28.87Mb; India VII 29.25Mb; Mauritania I 28.43Mb; North Korean 29.65Mb
食蟹猴疟原虫 Plasmodium cynomolgi 2012.08 Nature Genetics  疟原虫科、疟原虫属 26.2Mb
勇地雀 Geospiza fortis 2012.08 GigaScience 地雀属 1.07 Gb
牡蛎 Crassostrea gigas 2012.09 Nature  软体动物门、牡蛎科 559 Mb
姬鹟  Ficedula albicollis 2012.10 Nature  鹟科、姬鹟属 1.13Gb
毛里求斯果蝇 Drosophila mauritiana 2012.10 Genome Research 果蝇科、果蝇属  
骆驼 Camelus bactrianus  2012.11 Nature Communications 骆驼科、骆驼属、双峰驼种 2.38Gb
家猪 Sus scrofa 2012.11 Nature  猪科、猪属 2.6Gb
五指山猪 Sus scrofa 2012.11 GigaScience 猪科、猪属 2.6 Gb
帽贝、海蠕虫、淡水水蛭 Lottia gigantea, Capitella teleta, Helobdella robusta 2012.12 Nature  软体动物、腹足纲;环节动物、多毛纲;环节动物、蛭纲、水蛭科 348Mb,324Mb,228Mb
蝙蝠  Pteropus alecto,Myotis davidii 2012.12 Science 狐蝠科;蝙蝠科、鼠耳蝠属 2.00Gb,1.94Gb
家山羊 Capra hircus 2012.12 Nature Biotechnology 牛科、羊亚科、山羊属 2.92G
小菜蛾 Plutella xylostella 2013.01 Nature Genetics 鳞翅目、菜蛾科 343Mb
鸽子 Columba livia 2013.01 Science 鸠鸽科、鸽属 1.3 Gb
树鼩 Tupaia belangeri 2013.02 Nature Communications 树鼩科、树鼩属 3.2Gb
七鳃鳗 Petromyzon marinus 2013.02 Nature Genetics 七鳃鳗科 816Mb
四种绦虫 Echinococcus multilocularis;E. granulosus;Taenia solium ;Hymenolepis microstoma 2013.03 Nature 扁形动物门、绦虫纲 115-141Mb
游隼、猎隼 Falco peregrinus;Falco cherrug 2013.03 Nature 隼科、隼属 1.2Gb
西部锦龟 Chrysemys picta bellii 2013.03 Genome Biology  沼泽龟科、锦龟属

2.59Gb
山松甲虫 Dendroctonus ponderosae Hopkins 2013.03 Genome Biology  鞘翅目、小蠹科 208 Mb
月光鱼 Xiphophorus maculatus 2013.03 Nature Genetics 花鳉科、剑尾鱼属 750–950 Mb
地山雀 Pseudopodoces humilis 2013.03 Genome Biology  山雀科、地山雀属 1.1 Gb
斑马鱼 Danio rerio 2013.04 Nature 鲤科、鱼丹属 1.4 Gb
腔棘鱼 Latimeria chalumnae 2013.04 Nature 矛尾鱼科 2.86 Gb
中华鳖和绿海龟 Pelodiscus sinensis ;Chelonia mydas 2013.04 Nature Genetics 鳖科、中华鳖属;海龟科、海龟属  2.21 Gb;2.24Gb
藏羚羊 Pantholops hodgsonii 2013.05 Nature Communications 牛科、藏羚属 2.75 Gb
绯红金刚鹦鹉 Ara macao 2013.05 PLoS ONE 鹦鹉科、金刚鹦鹉属 1.11–1.16 Gbp
北京鸭 Anas platyrhynchos 2013.06 Nature Genetics 鸭科、鸭属 1.2 Gb
按蚊 Anopheles darlingi 2013.06 Nucleic Acids Research 蚊科、按蚊属 201 Mb
太平洋蓝鳍金枪鱼 Thunnus orientalis 2013.06 PNAS 鲭科、金枪鱼属 800 Mb
地山雀  Parus humilis 2013.07 Nature Communications 山雀科、地山雀属 1.08G
蛭形轮虫 Adineta vaga 2013.07 Nature 轮虫纲 244 Mb
扬子鳄 Alligator sinensis 2013.08 Cell Research 短吻鳄科、短吻鳄属 2.3 Gb
中国仓鼠 Cricetulus griseus 2013.08 Nature Biotechnology 仓鼠科 2.33 Gb
布氏鼠耳蝠 Myotis brandtii 2013.08 Nature Communications 蝙蝠科、鼠耳蝠属 2 Gb
捻转血矛线虫 Haemonchus contortus 2013.08 Genome Biology  毛圆科、血矛属 320 Mb
细粒棘球绦虫 Echinococcus granulosus 2013.09 Nature Genetics 带科、棘球属 151.6 Mb
东北虎 Panthera tigris  2013.09 Nature Communications 猫科、豹属 2.4G
东亚钳蝎 Mesobuthus martensii 2013.10 Nature Communications 钳蝎科、钳蝎属 1.3G
              
更新
 Baiji          Lipotes vexillifer        2013.10  Nature Communications            2.53G
扁颈眼镜蛇    king cobra               2013.10   PNAS     

小须鲸   Balaenoptera acutorostrata  2013.11      Nature Genetics                 2.44G

 蟒蛇     Python molurus bivittatus     2013.12       PNAS
   白蚁                 termite genome        2014.05        NC
绵羊                    Sheep (Ovis aries) 2014.05       Science
   采采蝇                Tsetse Fly (Glossina morsitans) 2014.05       Science
                                   rats Spalax                             2014.06       NC
Nomascus leucogenys  Nauture 2014.9
Cyprinus carpio               NG         2014.09
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