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云之南

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专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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转录因子  

2012-05-03 11:13:26|  分类: 遗传与基因组学 |  标签: |举报 |字号 订阅

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在分子生物学中,转录因子(Transcription factor)是指能够结合在某基因上游特异核苷酸序列上的蛋白质,这些蛋白质能调控其基因的转录。转录因子可以调控核糖核酸聚合酶(RNA聚合酶,或叫RNA合成酶)与DNA模板的结合。转录因子一般有不同的功能区域,如DNA结合结构域与效应结构域。转录因子不单与基因上游的启动子区域结合,也可以和其它转录因子形成转录因子复合体来影响基因的转录。
转录因子的调节是一个十分复杂的过程, 因为它取决于很多因素,其中最明显的是其他的DNA结合蛋白(包括转录因子等)以及局部的染色体结构. 早期的体外实验认为DNA序列决定转录因子的装配顺序,但愈来愈多的证据显示转录的激活取决于大量的转录因子的相互作用。目前表观遗传学似乎对转录激活也扮演重要角色。

转录因子是通过它们与启动子的特定结构如上游调控元件或增强子区域的亲和力首次被发现的这些因子与被调控基因的5’上游端调控区内的特异性DNA基序结合活化或抑制靶基因的转录表达最后通过基因产物的作用对外界信号在生理生化等方面做出适合的调节反应。在此调节反应中与转录因子结合的特定DNA基序被称为顺式作用元件参与作用的转录因子被称为反式作用因子。

转录因子的结构一般由DNA结合结构域DNA binding domain, DBD转录激活结构域activation domain, AD、核定位信号、寡聚化位点四个功能域组成。DNA的结合结构域在进化上是保守的。同源的转录调控因子的DBDs氨基酸序列具有一定的相似性所以DBD的研究具有代表性意义。根据蛋白质结构上的特征,转录因子的DNA结合结构域大体有锌指zinc fingers、碱性亮氨酸拉链basic leucine zippers、螺旋-转角-螺旋helix-turn-helixHTH和螺旋--螺旋helix-loop-helixHLH4种主要类型。目前研究的转录因子除了含有上述四种DBD的某种类型以外植物中分布广泛的AP2/EREBP超家族转录因子的研究也是越来越深入它的DBD

是由一个反向平行的α-螺旋和三个β-片层构成。

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