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云之南

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关于我

专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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2011-05-21 22:00:04|  分类: 生信数据库 |  标签: |举报 |字号 订阅

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NONCODE http://noncode.bioinfo.org.cn
植物中的noncodingRNA
www.prl.msu.edu/PLANTncRNAs
http://biobase.ibch.pozan.pl/ncRNA
http://www.imb-jena.de/RNA.html
Rfam (RNA families database of alignments and CM)
http://www.sanger.ac.uk/Software/Rfam

     
GenBank     http://www.ncbi.nlm.nih.gov/      
EMBL     http://www.ebi.ac.uk/      
DDBJ     http://www.ddbj.nig.ac.jp/Welcome-j.html      
Rfam     http://www.sanger.ac.uk/Software/Rfam      
NONCODE     http://www.bioinfo.org.cn/NONCODE/index.htm      
NPInter     http://www.bioinfo.org.cn/NPInter      
PLANTncRNAs     http://www.prl.msu.edu/PLANTncRNAs/      
RNAdb     http://research.imb.uq.edu.au/RNAdb      
miRBase     http://microrna.sanger.ac.uk/sequences/      
miRNAMap     http://mirnamap.mbc.nctu.edu.tw      
Argonaute     http://www.ma.uni-heidelberg.de/apps/zmf/argonaute/interface/      
MSKCC Computational Biology Center     http://cbio.mskcc.org/mirnaviewer/      
Patrocles     http://www.patrocles.org/      
siRNAdb     http://sirna.cgb.ki.se      
HuSiDa     http://itb.biologie.hu-berlin.de/~nebulus/sirna/index.htm      
siRNA Database     http://www.rnainterference.org/      
Rna Interference Research     http://www.si-rna.com/      
Yeast snoRNA Database     http://people.biochem.umass.edu/fournierlab/snornadb/main.php      
snoRNA-LBME-db     http://www-snorna.biotoul.fr/      
Plant snoRNA DB     http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home      
The tmRNA website     http://www.indiana.edu/~tmrna      
tmRDB     http://psyche.uthct.edu/dbs/tmRDB/tmRDB.html      
European rRNA database     http://www.psb.ugent.be/rRNA/      
RDP-II     http://rdp.cme.msu.edu/      
5S rRNA Database     http://biobases.ibch.poznan.pl/5SData/      
rRNA Mutation Databases     http://www.fandm.edu/Departments/Biology/Databases/RNA.html      
DRC     http://www.molgen.mpg.de/%7Eag_ribo/ag_brimacombe/drc/      
Greengenes     http://greengenes.lbl.gov      
tRNA Sequences     http://www.uni-bayreuth.de/departments/biochemie/trna/      
PLMItRNA     http://bighost.area.ba.cnr.it/PLMItRNA/      
Mamit-tRNA     http://mamit-trna.u-strasbg.fr/      
GtRNAdb     http://lowelab.ucsc.edu/GtRNAdb/      
AARS     http://rose.man.poznan.pl/aars/index.html      
Aptamer Database     http://aptamer.icmb.utexas.edu      
ARED     http://rc.kfshrc.edu.sa/ared      
CORG     http://corg.molgen.mpg.de      
FlyRNAi     http://flyRNAi.org/cgi-bin/RNAi_screens.pl      
HIV Sequence Database     http://hiv-web.lanl.gov/      
HyPaLib     http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/HyPa/      
Intronerator     http://hgwdev-hiram.cse.ucsc.edu/IntronWS120/      
IRESdb     http://ifr31w3.toulouse.inserm.fr/IRESdatabase/      
IRESite     http://www.iresite.org      
Mobile group II introns database     http://www.fp.ucalgary.ca/group2introns/      
MODOMICS     http://genesilico.pl/modomics/      
PolyA_DB     http://polya.umdnj.edu/polyadb/      
RNA Modification Database     http://medlib.med.utah.edu/RNAmods/      
RNAi codex     http://codex.cshl.org      
SELEXdb     http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/systems/selex/      
Subviral RNA Database     http://medstat.med.utah.edu/SSUmods/      
UTRdb/UTRsite    http://www.oxfordjournals.org/nar/database/summary/252      

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