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云之南

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专业背景:计算机科学 研究方向与兴趣: JavaEE-Web软件开发, 生物信息学, 数据挖掘与机器学习, 智能信息系统 目前工作: 基因组, 转录组, NGS高通量数据分析, 生物数据挖掘, 植物系统发育和比较进化基因组学

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RMySQL为MySQL安装  

2011-04-25 08:30:43|  分类: R&Bioconductor |  标签: |举报 |字号 订阅

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简要介绍:RMySQL为MySQL 数据库与R提供了接口
安装准备(1)
? Rtools:首先需要下载并安装一个Rtools。这个软件从http://www.murdoch-sutherland.com/Rtools/ 
   处获得。 
    1.软件版本必须与R的版本一致(可参考上述网页链接选择合适的版本) 
2. 软件安装完之后,默认的路径应该在C:\下,这时千万不要忘记,将C:\Rtools\bin加到系统环境变量Path里。同时也将C:\Program Files\R\R-2.10.1\bin加到系统环境变量里。
安装准备(2)
? MySQL Community Server, 
1.下载地址是 http://www.mysql.com/downloads/。
2.双击即可安装。安装的默认路径在C:\Program Files\MySQL。
安装准备(3)
? gcc准备
1.建议下载tdm-gcc-4.5.2 ,通常情况下win32平台下选择SJLJ(set jump long jump)
模型(来源于Mingw: http://tdm-gcc.tdragon.net/download ,安装参考http://www.cppblog.com/romangol/archive/2008/04/19/47595.aspx,但这个帖子太复杂了,其实我试了下,只要tdm-gcc-4.5.2安装了就好了。) 
 2.tdm-gcc安装好之后,默认的路径是C:\MinGW32,将C:\MinGW32\bin加到系统环境变量中
最后,
在R(如R-2.10.1 )控制台下输入install.packages(‘RMySQL’,type=‘source’)。
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